우리 모두 웃어봐요! 우리들의 이야기로.
유전자는 1과 2 두개 밖에 없습니다. Gene1은 1번과 2번 DNA strand로, Gene2는 3번과 4번 strand로 구성되어 있군요.
질문자가 착각하는 것은 1,2,3,4를 독립적인 유전자로 보는 것입니다.
일반적인 상황에서 볼때, 1, 3 strand가 유전정보를 가지고 있고, 2,4 strand는 상보적인 서열일 뿐 유전정보를 지니지 않습니다.(ORF가 아님)
위 그림에서 보여주는 것은 정리한면,
1단계 : primer1이 2번 strand에 붙어서 PCR합니다. 연결부위가 융합된 1번 strand가 형성되는 것이죠(1')
그림에는 빠져있는데, 5'쪽에 primer가 더 필요합니다. 아마도 primer3면 되겠네요
primer3이 변형된 1'strand에 붙어 PCR 되므로 2번 strand도 역시 수정됩니다.(2')
비슷하게 primer2에 의해 4번 strand가 수정되죠(4'). 3번도 수정됩니다.(3')
2단계 : 그림에서 primer3과 4로 PCR되는 것처럼 표기되어 있는데, 틀립니다.
strand도 이상하군요.
제대로 되려면, 1'과 4'이 만나야 합니다.
두 strand가 연결부위에서 붙어서(그림처럼) primer 역할을 해줍니다.
따라서 1'strand가 주욱 확장되어 1'-3'이 됩니다.(4'을 template으로 하면 3'이 합성되죠?)
반대의 경우는 2'-4'이 합성됩니다. 1'-3'과 2'-4'는 서로 상보적입니다.
3단계 : 1'-3'이나 2'-4' 같이 길어진 strand를 template로 primer3과 4가 PCR 합니다.
이러면 길어진 DNA가 증폭됩니다.
2/3단계는 따로 할수도 있지만 한번에 수행할 수 있습니다.
다 넣어주면(1', 2', 3', 4' + primer3/4) 알아서 주욱 진행됩니다.
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