코로나-19는 코로나바이러스는 새로운 바이러스가 아니고,
코로나바이러스라고 분류되는 새로운 바이러스가 발견된 것입니다.
바이러스 특성상 변이가 빠르지만, 바이러스 또한 생물이므로 거의 일정한 유전염기서열이 존재 할 수 밖에 없습니다. 이미 Corona-19, COVID-19, SARS-CoV-2 등으로 불리는 신종코로나바이러스에 대한 염기서열이 계속해서 밝혀지고 있습니다.
다양한 국가에서 발생한 신종 코로나 바이러스의 염기서열을 조사해보니 아래 그림처럼 거의 일정한 서열을 가진 것을 볼 수 있습니다. 이런 유전자 염기서열을 이용해 회사에서 진단키트를 개발하는 것이죠.
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134820300915?via%3Dihub
한국 첫번째 확진자의 코로나바이러스 유전체는 우한에서 분리된 reference 유전체와 비교했을때, 단 9군데의 유전적 변형이 발견되었고, 이는 진단키트로 진단하는데 아무런 문제가 없는 변형입니다.
Table 1. Genetic variations of our isolate (BetaCoV/Korea/SNU01/2020) compared to the NC_045512 reference genome of a SARS-CoV-2 isolated in Wuhan
Position | Gene | Ref | Alt | Ref AA | Alt AA | Total depth | Ref, % | Alt, % |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
2971 | ORF1ab | G | T | Met | Ile | 7917 | 31 | 69 |
6031 | ORF1ab | C | T | Asn | Asn | 7966 | 5 | 95 |
12115 | ORF1ab | C | T | Ser | Ser | 7875 | 33 | 67 |
15597 | ORF1ab | T | C | Tyr | Tyr | 7977 | 4 | 96 |
20936 | ORF1ab | C | T | Thr | Met | 7984 | 31 | 69 |
22224 | S | C | G | Ser | Trp | 7993 | 33 | 67 |
25775 | ORF3a | G | T | Trp | Leu | 7995 | 32 | 68 |
26144 | ORF3a | G | T | Gly | Val | 7885 | 0 | 100 |
26354 | E | T | A | Leu | His | 7609 | 36 | 64 |
https://jkms.org/DOIx.php?id=10.3346/jkms.2020.35.e84
진단에 실패할 정도의 염기서열을 대상으로 진단키트를 개발할 연구소는 없을 것이고, 진단이 실패 (20%면 실패입니다.)할 정도의 키트는 아예 승인이 나지를 않겠죠. 승인 받은 진단키트라면 신뢰도문제는 없을 것입니다.
진단의 특성상 바이러스유전자 최소 농도가 필요한데, 확진판정에 문제가 있다면, 어떤 상태의 환자시료를 언제 어디서 얻었냐가 문제겠죠.
바이러스가 막 침투한 환자의 가래나 구강샘플을 가지고 검사하면 당연히 음성이 나오겠지만, 37.5도 이상의 증상이 뚜렷한 코로나바이러스 환자의 혈액샘플에서 는 양성이 나오겠죠?
Comment ' 31